Trung tâm tư vấn và dịch vụ khoa học kỹ thuật có các chức năng chủ yếu sau:

a) Xây dựng hệ thống quản lý an toàn quốc tế cho các chủ tàu chạy biển tuyến quốc tế;

b) Kỹ thuật trong mua bán tàu thuỷ cho các chủ tàu trong và ngoài nước;

c) Kỹ thuật trong đóng mới, sửa chữa, hoán cải, trang bị lại phương tiện vận tải đường thuỷ, đường bộ;

d) Giám định kỹ thuật, đánh giá tổn thất do tai nạn hoặc rủi ro của phương tiện vận tải đường thuỷ, đường bộ;

e) Kỹ thuật vận chuyển hàng nguy hiểm, siêu trường, siêu trọng của phương tiện vận tải đường thuỷ, đường bộ;

g) Quy trình trang bị, lắp đặt máy, thiết bị phục vụ việc chế tạo sản phẩm công nghiệp trong ngành GTVT;

h) Ðầu tư nghiên cứu, ứng dụng chuyển giao công nghệ đóng tàu, trang bị an toàn hàng hải, thiết bị kiểm tra máy móc, thiết bị và phương tiện đường bộ, đường sắt, đường thuỷ;

i) Phòng chống ô nhiễm môi trường, khắc phục ô nhiễm môi trường do phương tiện vận tải gây ra;

j) Xây dựng hệ thống quản lý chất lượng theo tiêu chuẩn ISO 9000 và hệ thống quản lý môi trường theo tiêu chuẩn 14000;

k) Ðánh giá tác động môi trường đối với các công trình, dự án trong lĩnh vực giao thông vận tải;

l) Xuất nhập khẩu phương tiện, trang thiết bị, máy móc phục vụ cho hoạt động Ðăng kiểm.